HERRAMIENTA BIOINFORMÁTICA BAJO PERL Y LINUX, PARA LA DETERMINACIÓN DE PATRONES DE ADN, IMPLICADOS EN LA REGULACIÓN TRANSCRIPCIONAL DE LOS GENES

Abstract

El presente artículo expone un programa elaborado en PERL y ejecutado bajo Linux, que permite extraer secuencias flanqueadoras de genes de genomas completos de procariotas y compararlas entre sí, con el objetivo de encontrar posibles secuencias comunes de unión a factores de transcripción (proteínas que regulan la transcripción luego de una translocación nuclear debido a una interacción específica con ADN o por una interacción estequiométrica con una proteína que puede unirse al complejo secuencia- ADN específico-proteína1). Los conjuntos de genes se han organizado a partir de experimentos de micro arreglos de ADN.